Runda wstępna - 16/17 lipca:

1. Wda Świecie - Rozwój Katowice 
2. GKS 1962 Jastrzębie - Olimpia Grudziądz 
3. Świt Skolwin - Polonia Bytom 
4. Rominta Gołdap - wolny los (**) 
5. JKS 1909 Jarosław - ROW 1964 Rybnik 
6. KS Stilon Gorzów Wielkopolski - Pogoń Siedlce 
7. Lechia Tomaszów Mazowiecki - Stal Mielec 
8. Odra Opole - Siarka Tarnobrzeg 
9. KSZO 1929 Ostrowiec Świętokrzyski - wolny los (**) 
10. Miedź II Legnica - GKS Bełchatów 
11. ŁKS 1926 Łomża - GKS Tychy 
12. KKS 1925 Kalisz - MKS Kluczbork 
13. Małopolski ZPN (*) - Puszcza Niepołomice 
14. Chełmianka Chełm - Olimpia Zambrów 
15. Świt Nowy Dwór Mazowiecki - Znicz Pruszków 
16. Pomorski ZPN (*) - Kotwica Kołobrzeg 
17. Radomiak Radom - Stal Stalowa Wola
18. Nadwiślan Góra - Legionovia Legionowo 
19. Raków Częstochowa - Wisła Puławy 
20. Błękitni Stargard Szczeciński - Gryf Wejherowo 

(*) zdobywca Pucharu Polski na szczeblu ZPN 
(**) Dolcan Ząbki i Okocimski KS Brzesko wycofały się z rozgrywek I i II ligi w sezonie 2015/2016 i nie są uwzględniane jako uczestnicy tych rozgrywek 

Gospodarzami meczów rundy wstępnej Pucharu Polski są zdobywcy Pucharu Polski na szczeblu ZPN. W przypadku meczów z udziałem pozostałych drużyn, gospodarzami są zespoły występujące w niższej klasie rozgrywkowej w sezonie 2016/2017. 

W przypadku meczów z udziałem drużyn uczestniczących w sezonie 2016/2017 w rozgrywkach tej samej klasy, gospodarzami meczów będą zespoły, które podczas losowania par rundy wstępnej zostały wylosowane jako pierwsze. 

I runda - 23/24 lipca:

21. Zwycięzca meczu nr 15 - Wigry Suwałki 
22. Zwycięzca meczu nr 16 - Chojniczanka Chojnice 
23. Rominta Gołdap - Arka Gdynia (26/27 lipca) 
24. Zwycięzca meczu nr 19 - Chrobry Głogów 
25. Zwycięzca meczu nr 8 - Sandecja Nowy Sącz 
26. Zwycięzca meczu nr 10 - Miedź Legnica 
27. Zwycięzca meczu nr 18 - Zagłębie Sosnowiec 
28. Zwycięzca meczu nr 2 - wolny los (***) 
29. Zwycięzca meczu nr 20 - Bytovia Bytów 
30. Zwycięzca meczu nr 7 - Wisła Płock (26/27 lipca) 
31. Zwycięzca meczu nr 17 - GKS Katowice 
32. Zwycięzca meczu nr 5 - Stomil Olsztyn 
33. KSZO 1929 Ostrowiec Świętokrzyski - Zwycięzca meczu nr 6 
34. Zwycięzca meczu nr 3 - Zwycięzca meczu nr 12 
35. Zwycięzca meczu nr 1 - Zwycięzca meczu nr 13 
36. Zwycięzca meczu nr 14 - Zwycięzca meczu nr 11 

(***) Drużyna Zawiszy Bydgoszcz, uczestnicząca w rozgrywkach I ligi w sezonie 2015/2016, nie przystąpi do rozgrywek w sezonie 2016/2017.

Gospodarzami meczów I rundy Pucharu Polski są zdobywcy Pucharu Polski na szczeblu ZPN. W przypadku meczów z udziałem pozostałych drużyn, gospodarzami są zespoły występujące w niższej klasie rozgrywkowej w sezonie 2016/2017. 

W przypadku meczów z udziałem drużyn uczestniczących w sezonie 2016/2017 w rozgrywkach tej samej klasy, gospodarza wyłoni losowanie przeprowadzone przez Departament Rozgrywek Krajowych PZPN po rozegraniu meczów rundy wstępnej. 

W związku z trwającym procesem licencyjnym możliwa jest zmiana gospodarzy poszczególnych meczów.